Алиса Баркан - Alice Barkan

Алиса Баркан
Альма-матерМассачусетский Институт Технологий
Университет Висконсина
Научная карьера
УчрежденияОрегонский университет
ДокторантДжанет Э. Мерц[1]

Алиса Баркан американский молекулярный биолог и профессор биологии Орегонский университет. Она известна своей работой над хлоропласт генная регуляция и синтез белка.

Образование

Алиса Баркан приняла ее Б.С. из Массачусетский Институт Технологий.

В 1983 году закончила Кандидат наук. от Университет Висконсина под присмотром Джанет Э. Мерц, с диссертацией "Характеристика обезьяньего вируса 40 мутантов области позднего лидера".[2][3][4]

Карьера

Баркан присоединился к Орегонский университет в 1991 г., где в настоящее время является профессором Института молекулярной биологии.[5]

Баркан был назван членом Американская ассоциация развития науки в 2017 году.[6]

В 2018 году Баркан получил премию Лоуренса Богорада за выдающиеся достижения в исследованиях биологии растений от Американское общество биологов растений.

Баркан был избран членом Национальной академии наук в 2020 году.[7]

Исследование

Исследования Баркана сосредоточены на том, как белки, кодируемые ядром, влияют на хлоропласт экспрессия гена.[8][9][10] В экспериментах из ее лаборатории используются мутанты, в основном кукуруза (Zea Mays) но также Arabidopsis thaliana, исследовать хлоропласт мРНК перевод и стабильность, а также многие аспекты созревания РНК, включая сращивание и редактирование.[11][12][13] Баркан и ее коллеги обнаружили и изучили десятки ядерных генов растений, которые кодируют белки, связывающие РНК хлоропластов, которые напрямую влияют на многие аспекты метаболизма РНК (процессинг, сплайсинг, трансляция, стабильность).[14] Большинство белков, кодируемых ядром, которые описал Баркан, содержат пентатрикопептидные повторы (PPR).[15] Баркан также обнаружил и назвал CRM (сплайсинг РНК хлоропластов и созревание рибосом ), который находится в кодируемых ядром белках, необходимых для сплайсинга РНК хлоропластов.[16][17] В 2019 году Баркан и его коллеги успешно сконструировали белки PPR, которые связывают определенные последовательности РНК. in vivo, таким образом создавая систему для создания целевых взаимодействий белок-РНК.[18][19]

Личная жизнь

Баркан является одним из основателей музыкальной группы Byrdsong Renaissance Consort, с которой она играет на виоле и блокфлейте.[20]

Рекомендации

  1. ^ "Биографические данные Джанет Мерц, 1984 год". Репозиторий архивов CSHL. Получено 24 мая 2019.
  2. ^ "Алиса Баркан". Университет Орегона - Институт молекулярной биологии. Получено 24 мая 2019.
  3. ^ "Диссертация Алисы Баркан". Библиотеки Университета Висконсина. Получено 17 июля 2019.
  4. ^ "Биографические данные Джанет Мерц, 1984 год". Репозиторий архивов CSHL. Получено 24 мая 2019.
  5. ^ "Алиса Баркан". molbio.uoregon.edu. Получено 2020-06-14.
  6. ^ «Шесть преподавателей UO названы стипендиатами AAAS». Орегонский университет. Получено 24 мая 2019.
  7. ^ «Выборы в НАН Беларуси-2020». www.nasonline.org. Получено 2020-05-02.
  8. ^ Баркан, Алиса; Маленький, Ян (2014-04-29). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях». Ежегодный обзор биологии растений. 65 (1): 415–442. Дои:10.1146 / annurev-arplant-050213-040159. ISSN  1543-5008.
  9. ^ Watkins, Kenneth P .; Уильямс-Кэрриер, Розалинд; Чотевутмонтри, Пракитчай; Фризо, Джулия; Тойбнер, Марлен; Белчер, Сьюзен; Руве, Ханнес; Шмитц-Линневебер, Кристиан; Вейк, Клаас Й. ван; Баркан, Алиса (2020). «Изучение протеома, связанного с мРНК, кодирующей белок реакционного центра D1 Фотосистемы II в хлоропластах растений». Журнал растений. 102 (2): 369–382. Дои:10.1111 / tpj.14629. ISSN  1365-313X.
  10. ^ Чотевутмонтри, Пракитчай; Баркан, Алиса (2016-07-14). Уоллман, Фрэнсис-Андре (ред.). «Динамика трансляции хлоропластов при дифференцировке хлоропластов кукурузы». PLOS Genetics. 12 (7): e1006106. Дои:10.1371 / journal.pgen.1006106. ISSN  1553-7404. ЧВК  4945096. PMID  27414025.
  11. ^ Баркан, А. (1988-09-01). «Белки, кодируемые сложной единицей транскрипции хлоропластов, транслируются каждый как с моноцистронной, так и с полицистронной мРНК». Журнал EMBO. 7 (9): 2637–2644. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03116.x. ISSN  0261-4189. ЧВК  457051.
  12. ^ Баркан, А. (1993-04-01). «Ядерные мутанты кукурузы с дефектами сборки полисома хлоропласта изменили метаболизм РНК хлоропласта». Растительная клетка. 5 (4): 389–402. Дои:10.1105 / tpc.5.4.389. ISSN  1040-4651. ЧВК  160279. PMID  12271069.
  13. ^ Jenkins, B.D .; Кульханек, Д. Дж .; Баркан, А. (1997-03-01). «Ядерные мутации, которые блокируют сплайсинг РНК группы II в хлоропластах кукурузы, выявляют несколько классов интронов с различными требованиями к факторам сплайсинга». Растительная клетка. 9 (3): 283–296. Дои:10.1105 / tpc.9.3.283. ISSN  1040-4651. ЧВК  156918. PMID  9090875.
  14. ^ Баркан, Алиса; Гольдшмидт-Клермон, Мишель (2000-06-07). «Участие ядерных генов в экспрессии генов хлоропластов». Биохимия. 82 (6): 559–572. Дои:10.1016 / S0300-9084 (00) 00602-7. ISSN  0300-9084.
  15. ^ Баркан, Алиса; Маленький, Ян (2014-04-29). «Пентатрикопептидные повторяющиеся белки в растениях». Ежегодный обзор биологии растений. 65 (1): 415–442. Дои:10.1146 / annurev-arplant-050213-040159. ISSN  1543-5008.
  16. ^ Остхаймер, Г. Дж. (1 августа 2003 г.). «Факторы сплайсинга интронов группы II, полученные в результате диверсификации древнего РНК-связывающего домена». Журнал EMBO. 22 (15): 3919–3929. Дои:10.1093 / emboj / cdg372. ISSN  1460-2075. ЧВК  169045. PMID  12881426.
  17. ^ де Лонжевиаль, Андеол Фалькон; Small, Ian D .; Лурин, Клэр (2010). «Ядерно кодируемые факторы сплайсинга, участвующие в сплайсинге РНК в органеллах высших растений». Молекулярный завод. 3 (4): 691–705. Дои:10.1093 / mp / ssq025.
  18. ^ Макдермотт, Джеймс Дж .; Watkins, Kenneth P .; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Баркан, Алиса (2019-08-01). «Захват рибонуклеопротеина с помощью экспрессии in vivo конструкторского белка пентатрикопептидного повтора в Arabidopsis». Растительная клетка. 31 (8): 1723–1733. Дои:10.1105 / tpc.19.00177. ISSN  1040-4651. ЧВК  6713294. PMID  31123048.
  19. ^ Рохас, Маргарита; Юй Циго; Уильямс-Кэрриер, Розалинда; Малига, Пал; Баркан, Алиса (2019). «Сконструированные белки PPR как индуцибельные переключатели для активации экспрессии трансгенов хлоропластов». Природа Растения. 5 (5): 505–511. Дои:10.1038 / s41477-019-0412-1. ISSN  2055-0278.
  20. ^ "Консорт Возрождения Byrdsong". byrdsongconsort.com. Получено 2020-06-14.

внешняя ссылка