BURP домен - BURP domain
| ОТРЫЖКА | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ОТРЫЖКА | ||||||||
| Pfam | PF03181 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004873 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии BURP домен это ~ 230-аминокислота белковый домен, названный в честь четырех первоначально идентифицированных членов группы: BNM2, USP, RD22 и PG1beta. Он находится в C-терминал часть ряда растение клеточная стенка белки, которые определяются не только доменом BURP, но и общим сходством их модульной конструкции. Домен BURP белки состоит из трех или четырех модулей: (i) N-терминал гидрофобный домен - предполагаемый транзитный пептид, присоединенный к (ii) короткому консервированный сегмент или другой короткий сегмент, (iii) необязательный сегмент, состоящий из повторяющихся единиц, который уникален для каждого члена, и (iv) C-концевой домен BURP. Хотя домен BURP белки разделить первичный структурный особенности, их выражение шаблоны и условия, при которых они выразил отличаются. Наличие консервированный Домен BURP на разных заводах белки предполагает важную роль этого домена.[1] Возможно, домен BURP представляет собой общий мотив для локализации белков внутри клетка настенная матрица. Другой структурный домены связанный с доменом BURP, может определять другие целевые сайты для межмолекулярных взаимодействий.[2]
Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен BURP, перечислены ниже:[1][2][3]
- Brassica белок BNM2, который выразил вовремя индукция из микроспора эмбриогенез.
- Бобы полевые УТП, обилие без хранения семя белки с неизвестной функцией.
- Соя USP-подобные белки ADR6 (или SALI5-4A), ауксин -репрессируемый, алюминий -индуцибельный белок и SALI3-2, белок, который активируется алюминием.
- Соя семенная оболочка BURP-домен белок 1 (SCB1). Это может сыграть роль в дифференциация семенной оболочки клетки паренхимы.
- Арабидопсис RD22 засуха индуцированный белок.
- Кукуруза ZRP2, белок неизвестной функции в паренхиме коры.
- Помидор PG1beta, бета-субъединица полигалактуроназа изофермент 1 (PG1), что выражается в созревании фрукты.
- Каша РАФТИН. Это особенно важно на этапе созревания пыльца разработка.
Рекомендации
- ^ а б Хаттори Дж., Бутилье К.А., ван Лукерен Кампань М.М., Мики Б.Л. (сентябрь 1998 г.). «Консервативный домен BURP определяет новую группу растительных белков с необычной первичной структурой». Мол. Генерал Жене. 259 (4): 424–8. Дои:10.1007 / s004380050832. PMID 9790599. S2CID 21359007.
- ^ а б Бэтчелор А.К., Бутилье К., Миллер С.С., Хаттори Дж., Боуман Л.А., Ху М., Лантин С., Джонсон Д.А., Мики Б.Л. (август 2002 г.). «SCB1, ген белка BURP-домена, из развивающихся оболочек семян сои». Planta. 215 (4): 523–32. Дои:10.1007 / s00425-002-0798-1. PMID 12172833. S2CID 19185882.
- ^ Ван А., Ся Цюй, Се В., Датла Р., Селварадж Г. (ноябрь 2003 г.). «Классические тельца Убиша содержат структурный белок, продуцируемый спорофитами (РАФТИН), который необходим для развития пыльцы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (24): 14487–92. Bibcode:2003PNAS..10014487W. Дои:10.1073 / pnas.2231254100. ЧВК 283618. PMID 14612572.