Экпома вирус - Ekpoma virus
| Вирусы Экпомы | |
|---|---|
Научная классификация | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Учебный класс: | Monjiviricetes |
| Заказ: | Mononegavirales |
| Семья: | Rhabdoviridae |
| Род: | Тибровирус |
| Включенные группы[1] | |
| Кладистски включены, но традиционно исключены таксоны[1] | |
Вирусы Экпомы, включая Экпома 1 тибровирус (ЭКВ-1) и Экпома 2 тибровирус (ЭКВ-2), являются орфанные вирусы не связано ни с каким заболеванием. Они есть вирусы с отрицательной РНК и члены рабдовирус семья. Оба вируса были обнаружены в 2015 году в образцах крови двух здоровых женщин, проживающих в Экпома, Нигерия.[2] EKV-2, по-видимому, широко распространен, и около 45% людей, живущих в Экпоме и его окрестностях, ранее подвергались воздействию.[2] Оба вируса обладают очень широким клеточным тропизмом и способностью инфицировать широкий спектр рака человека. Сотовые линии.[3] Ни один из вирусов не был изолирован, что затрудняет исследования.
Открытие
ЭКВ-1 и ЭКВ-2 были обнаружены в плазма образцы у 45-летней женщины и у 19-летней девушки, соответственно. Ни одна из женщин не поступила с какими-либо признаками болезни, и, согласно отчету 2015 года, образцы были собраны в качестве контроля в более крупном метагеномика изучать. Вирусы были идентифицированы с помощью секвенирование следующего поколения.
Клиническое заболевание
EKV-1 и EKV-2 - орфанные вирусы, не связанные ни с одним заболеванием. Согласно отчету 2015 года, женщина, инфицированная EKV-1, не могла вспомнить ни одного эпизода болезни в течение недель или месяцев после взятия пробы. Женщина, инфицированная EKV-2, вспомнила, что через несколько недель после взятия пробы у нее поднялась температура. Ей поставили диагноз и лечили от малярия.
Виремия
В титры из виремия наблюдаемый у женщин колебался от 45000 копий РНК / мл плазмы (EKV-2) до 4,5 миллионов копий РНК / мл плазмы (EKV-1).
Распространенность
Исследователи использовали иммуноферментный анализ (ELISA ) обнаружить антитела которые признают нуклеокапсид белок ЭКВ-1/2. Они сообщили, что 5% людей, живущих в Экпоме и его окрестностях, подвергались воздействию EKV-1 и 45% - EKV-2.
Передача инфекции
В естественный резервуар и режим трансмиссии для ЭКВ-1/2 неизвестны. На основе естественного водоема и вектор для других тибровирусы, исследователи предположили, что кусающие мошки может передавать вирусы людям.[4]
Геном
Опубликованный геномы ЭКВ-1 и ЭКВ-2 не комплектуются. Однако, исходя из доступной последовательности, геном содержит типичные пять открытые рамки для чтения присутствует во всех рабдовирусах (N, P, M, G и L). Вирусы также включают три открытые рамки считывания с неизвестной функцией (U1, U2 и U3). Предполагается, что U3 - это виропорин на основе сходства последовательностей с другими виропоринами.[5]
Генетическая дивергенция
Хотя EKV-1 и EKV-2 были обнаружены в одной деревне на юго-западе Нигерии, их общая гомология составляет всего 33% аминокислота уровень.
Одно заметное различие между двумя вирусами заключается в длине фосфопротеин (П). Фосфопротеин EKV-1 содержит на 115 аминокислот больше, чем фосфопротеин EKV-2.
Также заметны различия в конверт гликопротеин. Обволакивающие гликопротеины EKV-1 и EKV-2 идентичны только на 27% на уровне аминокислот.
Репликация
ЭКВ-1 и ЭКВ-2 клеточные рецепторы не идентифицированы. Однако тропизм ЭКВ-1 и ЭКВ-2 был изучен с использованием рекомбинантный вирус везикулярного стоматита (VSV), которые экспрессируют гликопротеины EKV-1 или EKV-2. Частицы VSV, которые экспрессируют гликопротеины EKV-1 и EKV-2, превосходят нативный гликопротеин VSV. Эти частицы способны проникать в широкий спектр человеческих и нечеловеческих клеток.[3]
Шаги в жизненном цикле репликации после входа частицы не выяснены.
Рекомендации
- ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2018b» (HTML). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2019 г.. Получено 3 февраля 2020.
- ^ а б Стремлау М.Х., Андерсен К.Г., Фоларин О.А. и др. Открытие новых рабдовирусов в крови здоровых людей из Западной Африки. PLoS Negl Trop Dis. 2015; 9 (3): e0003631. Опубликовано 17 марта 2015 г. doi: 10.1371 / journal.pntd.0003631
- ^ а б Caì Y, Yú S, Jangra RK и др. Клетки человека, нечеловека приматов и летучих мышей широко восприимчивы к проникновению в клетки тибровирусных частиц. Передний микробиол. 2019; 10: 856. Опубликовано 26 апреля 2019 г. doi: 10.3389 / fmicb.2019.00856
- ^ Губала А., Дэвис С., Вейр Р., Мелвилл Л., Коулед С., Бойл Д. Рабдовирусы тиброгаргана и прибрежных равнин: геномная характеристика, эволюция новых генов и серологическая распространенность в австралийском животноводстве. Дж. Ген Вирол. 2011; 92 (Pt 9): 2160–2170. DOI: 10.1099 / vir.0.026120-0
- ^ Уокер П.Дж., Ферт С., Виден С.Г. и др. Эволюция размера и сложности генома рабдовирусов. PLoS Pathog. 2015; 11 (2): e1004664. Опубликовано 13 февраля 2015 г. doi: 10.1371 / journal.ppat.1004664