Эксцизионаз - Excisionase - Wikipedia

Белок, подобный эксцизионазе
PDB 2og0 EBI.jpg
кристаллическая структура комплекса лямбда xis-dna
Идентификаторы
СимволОтл
PfamPF07825
Pfam кланCL0123
ИнтерПроIPR012884

В молекулярной биологии эксцизионный это бактериофаг белок кодируется геном Xis. Он участвует в эксцизионных рекомбинация регулируя сборку эксцизивной интасомы и ингибируя популярный интеграция. Он имеет необычную крылатую спираль. структура в котором два альфа спирали упакованы против двух вытянутых прядей. Также в структуре присутствует двухцепочечный антипараллельный бета-лист, нити которого соединены крылом из четырех остатков. Во время взаимодействия с ДНК предполагается, что спираль альфа2 входит в большую канавку, в то время как крыло контактирует с соседними малая бороздка или же фосфодиэфир позвоночник. С-концевой участок эксцизионазы участвует во взаимодействии с кодируемыми фагом интегрировать (Int) и предполагаемый C-терминал альфа-спираль май складывать при взаимодействии с Int и / или ДНК.[1]

Рекомендации

  1. ^ Сэм, доктор медицины, Папагианнис CV, Коннолли К.М., Корселли Л., Ивахара Дж., Ли Дж., Филлипс М., Войджак Дж. М., Джонсон Р.С., Clubb RT (декабрь 2002 г.). «Регулирование направленности в бактериофаге лямбда-сайт-специфической рекомбинации: структура белка Xis». J. Mol. Биол. 324 (4): 791–805. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 01150-6. PMID  12460578.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR012884