HLA-B39 - HLA-B39 - Wikipedia

Иллюстрация HLA-B с пептидом в связывающем кармане.
HLA-B (альфа) -β2MG со связанным пептидом
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B39
АллелиВ * 3901, 3902, 3903,. .
Структура (Видеть HLA-B )
Общие данные
Locuschr.6 6п21.31

HLA-B39 (B39) - это HLA -B серотип. Серотип определяет наиболее распространенные генные продукты HLA-B * 39.[1]

B39 - это расщепленный антиген из широкий антиген B16, и является сестринским типом B38. B39 чаще всего встречается на западном побережье Тихого океана, в Японии и наиболее часто встречается в новом мире. В Европе встречается в Скандинавии и на севере России.

Серотип

Серотипы B39, B16 и B38 распознавание
Продукты гена HLA B * 39[2]
В * 39B39B16B38Образец
аллель%%%размер (N)
*390195476
*39028796
*39037720
*390582245
*390694508
*39084857
*39099713
*391082127
*39116916
Ссылка на все аллели на IMGT /HLA База данных на EBI

Серология наиболее распространенных аллелей B39, B * 3901 и B * 3906 хорошая, но некоторые продукты аллелей не обнаруживаются должным образом. Учитывая различное участие этих аллелей в диагностике заболеваний, необходимо проводить типирование с высоким разрешением.

HLA B * 3906 частот
частота
исх.численность населения(%)
[3]Венесуэла Перха Гора Бари23.9
Мексика Mixtec Oaxaca8.8
США Аризона Пима7.3
Латиноамериканцы из Южного Техаса5.6
Мексика Zaptotec Oaxaca4.5
Нью-Мексико Канончито Навахо3.7
Оман2.5
PNG Ванигела2.3
Тунис Тунис2.3
Уроженцы Северной Америки1.9
США испаноязычный1.7
Бразилия Белу-Оризонти1.6
Южная Дакота Лакота Сиу1.5
Кубинский белый1.4
Азорские острова С. Мария и С. Мигель1.3
Австралия Новый Южный Уэльс1.1
Финляндия1.1
Северная Португалия1.1
Центр Португалии1.0
Испания Восточная Андалусия Gipsy1.0
Бразилия Терена0.9
Ирландия Северная0.9
Азорские острова Терсейра0.8
США Кавказская поп20.8
Бразилия0.7
США Филадельфия кавказцы0.7
Индия Андхра-Прадеш Голла0.5
Таиланд0.4

Аллели

HLA B * 3901 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[3]Тайвань Сайсиат54.9
[3]Тайвань Цоу24.5
[3]Южная Дакота Лакота Сиу22.5
[3]Тайвань Тароко21.8
[3]Тайвань Атаял19.8
[3]PNG Ванигела16.7
[3]Япония Айну Хоккайдо16.0
[3]Тайваньский бунун14.9
[3]Нью-Мексико Канончито Навахо14.6
[3]Тайвань Тао13.3
[3]Тайвань Рукай13.0
[3]Тайвань Ами10.2
[3]США Гавайи Окинава7.7
[3]Папуа-Новая Гвинея Восера7.0
[3]Папуа-Новая Гвинея Маданг6.4
[3]Мексика Mixtec Oaxaca5.9
[3]Тайвань Пуюма5.0
[3]Тайвань Пайвань4.9
[3]Новая Каледония4.8
[3]Япония Центральная4.4
[3]американское Самоа4.0
[3]США уроженцы Северной Америки4.0
[3]Тайваньская хакка3.6
[3]Индиг. Австралийский полуостров Кейп-Йорк3.5
[3]Япония (5)3.5
[3]Филиппины Иватан3.0
[3]Бразилия2.9
[3]Китай Гуанси Маонан2.8
[3]Грузия Тибилиси Грузины2.8
[3]Китай Юньнань Ну2.6
[3]Таиланд2.5
[3]Азорские острова Терсейра2.4
[3]Сингапурский китайский2.4
[3]румынский2.3
[3]Китай Юньнань Лису2.2
[3]Индиг. Австралийский юендуму2.1
[3]Китай Гуанчжоу2.0
[3]Хорватия2.0
[3]Юго-Восток Франции1.9
[3]Грузия Сванети Сваны1.9
[3]PNG плато Кариму1.9
[3]Центральные острова Азорских островов1.8
[3]Испания Восточная Андалусия1.8
[3]Уганда Кампала1.6
[3]Мексика Zaptotec Oaxaca1.5
[3]Сингапур Тайский1.5
[3]Китай Гуанчжоу Хан1.4
[3]Китай Цинхай Хуэй1.4
[3]Чехия1.4
[3]Мадейра1.4
[3]Индиг. Австралийка Кимберли1.3
[3]Финляндия1.1

Болезнь

B39 считается фактором артериита Такаясу и желчных камней в Мексике.[4] Костно-суставные осложнения из бруцеллез похоже, связаны с B39.[5] Ассоциация с спондилоартропатии [6][7] и псориатический артрит[8][9] наблюдалась в нескольких исследованиях. Псориатический артрит похоже, связан с MICA -A9, который тесно связан с HLA-B39.[10][11] B39 также, кажется, участвует в Синдром Фишера вариант Синдром Гийена-Барре.[12]

B39, по-видимому, защищает от кардиомиопатии при Болезнь чаги указывая на возможный фактор отбора в его подъеме в Новом Свете.[13] Болезнь чаги вызывается трипаносома переносится кровососущими насекомыми, обитающими в тропических регионах, где выращивают пальмы.

Южная Калифорния теперь сообщает о случаях болезни чаги в результате переливания зараженной крови и, возможно, уже является средой обитания переносчика.[14]

При артериите Такаясу

Артериит Такаясу похоже, есть ссылка на B39.[15][16] Связь с B * 3902 увеличивает риск легочного инфаркт, ишемическая болезнь сердца, аортальная регургитация, системный гипертония, стеноз почечной артерии, цереброваскулярное заболевание и нарушение зрения.[17] Было обнаружено, что B * 3906, распространенный у коренных жителей Мезоамерики, связан с тем же заболеванием.[18]

HLA B * 3902 частоты
частота
исх.численность населения(%)
[3]Мексика Mixe Oaxaca38.7
Мексика Zaptotec Oaxaca13.4
Мексика Mixtec Oaxaca5.9
Мексика Местис1.2
Япония pop50.9
Кубинский белый0.7
Израиль Ашк. и Non Ashk. Евреи0.5
Япония Центральная0.5
Сенегал Ниохоло Манденка0.5
В * 3903
PNG Новая Британия Рабаул13.2
Бразилия Терена11.2
Аргентина Тоба Росарио5.2
Бразилия0.7
Финляндия0.6
Кения Луо0.6
Уроженцы Северной Америки0.5
В * 3904
Аргентина Тоба Росарио1.2
Грузия Сванети Сваны0.6
Иордания Амман0.3
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан0.1
Япония Центральная0.1
румынский0.1
В * 3905
Венесуэла Perija Yucpa36.1
Мексика Zaptotec Oaxaca12.7
Мексика Mixtec Oaxaca9.8
Мексика Местис4.9
Аризона Пима4.5
Мексика Гвадалахара Местис2.4
Аргентина Тоба Росарио2.3
США испаноязычный2.1
Мексика Mixe Oaxaca1.9
Кубинский белый1.4
Мексика Чихуахуа Тараумара1.1
США уроженцы Северной Америки0.5
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан0.2
В * 3907
Шицзячжуан Тяньцзянь Хан0.6
Сингапур Тайский0.5
Китай Южный Хан0.2
В * 3908
Мексика Zaptotec Oaxaca2.2
Мексика Местис1.2
Мексика Mixtec Oaxaca1.0
Бразилия0.7
США испаноязычный0.6
В * 3909
Венесуэла Perija Yucpa34.9
Таиланд pop33.1
Бразилия Терена1.7
Китай Южный Хан1.4
Аргентина Тоба Росарио1.2
Китай Цинхай Хуэй0.9
В * 3910
Суданский2.5
Сенегал Ниохоло Манденка2.1
Южноафриканский Натал Зулу1.5
Камерун Бети1.4
Испания Восточная Андалусия1.2
Кения Луо1.1
Израильские арабские друзы1.0
Кения Нанди1.0
Гвинея-Бисау0.8
Кения0.7
Мали Бандиагара0.7
Марокко Надор Металса Класс I0.7
Камерун Бамилеке0.6
Камерун Яунде0.5
Израиль Ашк. и Non Ashk. Евреи0.5
Саудовская Аравия Guraiat and Hail0.5

Рекомендации

  1. ^ Marsh, S.G .; Альберт, Э. Д .; Bodmer, W. F .; Bontrop, R.E .; Dupont, B .; Erlich, H.A .; Fernández-Viña, M .; Герати, Д. Э .; Holdsworth, R .; Hurley, C.K .; Lau, M .; Lee, K. W .; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, W. R .; Müller, C.R .; Parham, P .; Petersdorf, E.W .; Сасадзуки, Т .; Strominger, J. L .; Svejgaard, A .; Terasaki, P. I .; Tiercy, J.M .; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК  2848993. PMID  20356336.
  2. ^ получено из IMGT / HLA
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор ай az ба bb Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net ". Тканевые антигены. 61 (5): 403–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID  12753660. Внешняя ссылка в | название = (помощь)
  4. ^ Мендес-Санчес Н., Кинг-Мартинес А.С., Рамос М.Х., Пичардо-Бахена Р., Урибе М. (ноябрь 2004 г.). «Гены американских индейцев в популяции Мексики связаны с развитием желчнокаменной болезни». Являюсь. J. Гастроэнтерол. 99 (11): 2166–70. PMID  15554998.
  5. ^ Браво М.Дж., Колменеро Джде Д., Алонсо А., Кабальеро А. (май 2003 г.). «Аллель HLA-B * 39 придает предрасположенность к костно-суставным осложнениям при бруцеллезе человека». J. Rheumatol. 30 (5): 1051–3. PMID  12734905.
  6. ^ Собао Ю., Цучия Н., Такигучи М., Токунага К. (январь 1999 г.). «Перекрывающиеся пептид-связывающие специфичности HLA-B27 и B39: доказательства роли пептидного супермотива в патогенезе спондилоартропатий». Ревматоидный артрит. 42 (1): 175–81. Дои:10.1002 / 1529-0131 (199901) 42: 1 <175 :: AID-ANR21> 3.0.CO; 2-7. PMID  9920028.
  7. ^ Альварес I, Лопес де Кастро Х.А. (июль 2000 г.). «HLA-B27 и иммуногенетика спондилоартропатий». Curr Opin Rheumatol. 12 (4): 248–53. Дои:10.1097/00002281-200007000-00003. PMID  10910175.
  8. ^ Истмонд Си Джей (май 1994 г.). «Псориатический артрит. Генетика и антигены HLA». Клиническая ревматология Байера. 8 (2): 263–76. Дои:10.1016 / S0950-3579 (94) 80018-9. PMID  8076387.
  9. ^ Гладман Д.Д., Прощай, В.Т. (июнь 1995 г.). «Роль антигенов HLA как индикаторов прогрессирования заболевания псориатическим артритом. Многомерная модель относительного риска». Ревматоидный артрит. 38 (6): 845–50. Дои:10.1002 / арт.1780380619. PMID  7779129.
  10. ^ Болоньези Е., Дальфонсо С., Роландо В., Фазано М.Э., Пратико Л., Момильяно-Ричиарди П. (октябрь 2001 г.). «Микросателлитные аллели MICA и MICB в расширенных гаплотипах HLA». Евро. J. Immunogenet. 28 (5): 523–30. Дои:10.1046 / j.0960-7420.2001.00250.x. PMID  11881819.
  11. ^ Гонсалес С., Мартинес-Борра Дж., Лопес-Васкес А., Гарсия-Фернандес С., Торре-Алонсо Дж. К., Лопес-Ларреа С. (май 2002 г.). «MICA, а не MICB, TNFA или HLA-DRB1, связан с предрасположенностью к псориатическому артриту». J. Rheumatol. 29 (5): 973–8. PMID  12022360. Архивировано из оригинал на 2008-12-04. Получено 2008-08-03.
  12. ^ Юки Н., Сато С., Цудзи С., Огава К., Миятаке Т. (июнь 1993 г.). «Лейкоцитарные антигены человека при синдроме Фишера». Анна. Neurol. 33 (6): 655–7. Дои:10.1002 / ana.410330617. PMID  8498847.
  13. ^ Крус-Роблес Д., Рейес П.А., Монтеон-Падилья В.М., Ортис-Муньис АР, Варгас-Аларкон Г. (январь 2004 г.). «Гены MHC класса I и класса II у мексиканских пациентов с болезнью Шагаса». Гм. Иммунол. 65 (1): 60–5. Дои:10.1016 / j.humimm.2003.10.008. PMID  14700597.
  14. ^ «Болезнь Шагаса представляет собой новый вызов безопасности кровоснабжения».
  15. ^ Кимура А., Китамура Х, Дэйт У, Нумано Ф (август 1996). «Комплексный анализ генов HLA при артериите Такаясу в Японии». Int. Дж. Кардиол. 54 Дополнение: S61–9. Дои:10.1016 / s0167-5273 (96) 88774-2. PMID  9119528.
  16. ^ Йошида М., Кимура А., Кацураги К., Нумано Ф., Сасадзуки Т. (август 1993 г.). «Типирование ДНК гена HLA-B при артериите Такаясу». Тканевые антигены. 42 (2): 87–90. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1993.tb02242.x. PMID  7903491.
  17. ^ Китамура Х., Кобаяши Й., Кимура А., Нумано Ф. (октябрь 1998 г.). «Ассоциация клинических проявлений с аллелями HLA-B при артериите Такаясу». Int. Дж. Кардиол. 66 Приложение 1: S121–6. Дои:10.1016 / S0167-5273 (98) 00159-4. PMID  9951811.
  18. ^ Родригес-Рейна Т.С., Суньига-Рамос Дж., Сальгадо Н. и др. (Октябрь 1998 г.). «Последовательности интрона 2 и экзона 3 могут быть вовлечены в предрасположенность к развитию артериита Такаясу». Int. Дж. Кардиол. 66 Дополнение 1: S135–8, обсуждение S139. Дои:10.1016 / S0167-5273 (98) 00161-2. PMID  9951813.