Надсемейство Холинов III - Holin superfamily III - Wikipedia

В Надсемейство Холинов III это надсемейство интегральной мембранные транспортные белки. Это один из семи разных надсемейства холинов в итоге. В целом считается, что эти белки играют роль в регулируемой гибели клеток, хотя функциональность варьируется в зависимости от семейства и отдельных членов.

Члены суперсемейства холинов III происходят от Протеобактерии, Synergistetes, Актинобактерии, Деинококк и Археи. Это суперсемейство включает семь семейств TC:

Члены всех семейств (за исключением семейства Hol-X; TC № 1.E.34 ), по-видимому, имеет три трансмембранных сегмента (ТМС). Представители семейства Hol-X имеют два предполагаемых ТМС. Отсутствующий ТМС в белках семейства 34 является N-концевым ТМС, как обнаружено множественными выравниваниями.[1] Эти семь семейств имеют средний размер 110, 96, 105, 112, 143, 159 и 108 аминокислотных остатков (а.о.) соответственно. Обратите внимание, что единственное семейство, члены которого, по прогнозам, имеют только два TMS, - это семья, содержащая самые большие гомологи; это связано с гидрофильными расширениями. Средний размер белков во всем суперсемействе составляет 114 а.к. со стандартным отклонением 23 а.к.[1]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Reddy, Bhaskara L .; Сайер, Милтон Х. (1 ноября 2013 г.). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1828 (11): 2654–2671. Дои:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. ЧВК  3788059. PMID  23856191.