Lar1 - Lar1 - Wikipedia

LAR1 ('Лишайник -Ассоциированные Ризобиальные 1 ') относится к конкретной бактериальной линии в порядке Ризобиальные это чаще всего обнаруживается непосредственно в связи с лишайниками.[1]

В настоящее время известно, что эта линия связана с лишайниками, имеющими зеленые водоросли фотосинтетический партнер (в отличие от цианобактериальный партнер) и грибковый партнер в Леканоромицеты (хотя другие группы грибов еще не исследованы). Эта линия была задокументирована в связи со всеми специально протестированными зелено-водорослевыми лишайниками (все из Северной Америки), а также была обнаружена в библиотеке последовательностей, полученных из антарктических лишайников.[2] Конкретные экологическая ниша занятый этой линией, указывает на то, что он может полагаться на определенные питательные вещества, которыми много зеленых водорослей лишайников. слоевища но реже встречаются в других средах.

Фиксация азота

Линия LAR1 в настоящее время определяется на основе последовательностей Ген 16S рРНК в одиночку, так как он остается некультурным в лаборатории. Несмотря на его устойчивость к культивированию, по крайней мере одна потенциально значимая метаболическая функция может быть определена на основе косвенных доказательств: азотфиксация. С азот требуется для роста всех биологических систем, но, как правило, биологически недоступен из-за высокого энергия активации, многие эукариоты установили отношения со специализированными бактериями, способными фиксировать азот (преобразовывать газообразный азот в молекулярную форму, которая легко усваивается).[3]

Многие лишайники растут в среде с крайне низким содержанием питательных веществ и могут полагаться на азотфиксирующие бактерии, чтобы обеспечить их достаточным количеством молекулярного азота для выживания.[4] Многие исследователи документально подтвердили, что микробы, связанные с зелеными водорослевыми лишайниками, способны в большом количестве фиксировать азот.[5][6][7][8]

Однако почти все эти исследования основывались исключительно на методах культивирования, которые могут дать неточную картину того, какие азотфиксаторы наиболее распространены или важны. В независимых исследованиях лишайников использовались методы без культивирования для обнаружения присутствия nifH, первичного гена, участвующего в фиксации азота, и были обнаружены последовательности, которые обладают тем же филогенетическим сродством, что и линия LAR1.[1][9]

Однако разнообразие бактерий, обнаруженных в пробах окружающей среды, частота, с которой горизонтальный перенос генов происходит у бактерий, и отсутствие физиологических исследований делает невозможным окончательное утверждение относительно метаболической активности этой некультивируемой линии.

Рекомендации

  1. ^ а б Ходкинсон Б.П., Лутцони Ф. (2009). «Микробиотический обзор бактерий, связанных с лишайниками, показывает новую линию от Rhizobiales» (PDF). Симбиоз. 49 (3): 163–180. Дои:10.1007 / s13199-009-0049-3. Архивировано из оригинал (PDF) на 2012-10-17. Получено 2009-12-09.
  2. ^ Де ла Торре JR, Goebel BM, Friedmann EI, Pace, NR (2003). «Микробное разнообразие криптоэндолитических сообществ в Сухих долинах Мак-Мердо, Антарктида». Прикладная и экологическая микробиология. 69 (7): 3858–3867. Дои:10.1128 / AEM.69.7.3858-3867.2003. ЧВК  165166. PMID  12839754.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  3. ^ Кабельо П., Рольдан, доктор медицины, Морено-Вивиан С. (ноябрь 2004 г.). «Восстановление нитратов и азотный цикл у архей». Микробиология. 150 (Pt 11): 3527–46. Дои:10.1099 / мик. 0.27303-0. PMID  15528644.
  4. ^ Бродо, И.М. (1973). «Экология основания». В: Лишайники. Ахмаджихан В., Хейл М.Э., ред. Academic Press, Нью-Йорк и Лондон: 401–441.
  5. ^ Хенкель, П. А .; Плотникова Т. Т. (1973). «[Азотфиксирующие бактерии в лишайниках]». Известия Академии Наук СССР. Серия Биологическая (на русском). 6: 807–813.
  6. ^ Красильников Н.А. (1949). «Присутствует ли Azotobacter в лишайниках?». Микробиология. 18: 3.
  7. ^ Ламбрайт, Д. Д. Капустка, Л. А. (1981). «Ассоциация N2-фиксирующих бактерий с Dermatocarpon miniatum и Lepraria sp». Ботаническое общество Америки: разные серийные публикации. 160: 5.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  8. ^ Либа CM, Феррара FI, Manfio GP, Fantinatti-Garboggini F, Albuquerque RC, Pavan C, Ramos PL, Moreira CA, Barbosa HR (2006). «Азотфиксирующие хемоорганотрофные бактерии, выделенные из лишайников, лишенных цианобактерий, и их способность растворять фосфат и выделять аминокислоты и фитогормоны». Журнал прикладной микробиологии. 101 (5): 1076–1086. Дои:10.1111 / j.1365-2672.2006.03010.x. PMID  17040231.
  9. ^ Grube M, Cardinale M, Vieira de Castro J, Müller H, Berg G (2009). «Видовое структурное и функциональное разнообразие бактериальных сообществ в симбиозе лишайников». Журнал ISME. 3 (9): 1105–1115. Дои:10.1038 / ismej.2009.63. PMID  19554038.