Множественная изоморфная замена - Multiple isomorphous replacement

Множественная изоморфная замена (MIR) исторически является наиболее распространенным подходом к решению фазовая проблема в Рентгеновская кристаллография исследования белки. Для белковых кристаллов этот метод проводится путем вымачивания кристалла анализируемого образца с помощью тяжелый атом раствор или совместная кристаллизация с тяжелым атомом. Добавление тяжелого атома (или иона) в структуру не должно влиять на формирование кристаллов или ячейка размеры по сравнению с его родной формой, следовательно, они должны быть изоморфный.

Сначала собираются наборы данных из нативной пробы и производной с тяжелым атомом. Тогда интерпретация Карта различий Паттерсона показывает расположение тяжелого атома в элементарной ячейке. Это позволяет как амплитуда и фаза вклада тяжелого атома предстоит определить. Поскольку структурный фактор производной тяжелого атома (Fph) кристалла представляет собой векторную сумму неподеленного тяжелого атома (Fчас) и родной кристалл (Fп) потом фаза родная Fп и Fph векторы могут быть решены геометрически.

Необходимо оценить по крайней мере два изоморфных производных, поскольку использование только одного даст две возможные фазы.

Разработка

Единичное изоморфное замещение (SIR)

Ранние демонстрации изоморфного замещения в кристаллографии пришли из Пробка,[1] Джон Монтеат Робертсон,[2] и другие. Ранняя демонстрация изоморфного замещения в кристаллографии произошла в 1927 году с докладом о рентгеновских кристаллических структурах ряда квасцы соединения из Джеймс М. Корк.[1] В квасцы изучаемые соединения имели общую формулу A.B.(ТАК4)2.12H2O, где A - одновалентный ион металла (NH4+, K+, Руб.+, CS+, или же Tl+ ), B - ион трехвалентного металла (Al3+, Cr3+, или же Fe3+ ) и S обычно была серой, но также могла быть селен или же теллур. Поскольку кристаллы квасцов были в значительной степени изоморфными, когда тяжелые атомы были заменены, они могли быть фазированы путем изоморфного замещения. Для определения положений тяжелых атомов использовался анализ Фурье.

Первая демонстрация изоморфного замещения в кристаллографии белков была в 1954 г. Дэвид В. Грин, Вернон Ингрэм, и Макс Перуц.[3]

Множественное изоморфное замещение (MIR)

Примеры

Некоторые примеры тяжелых атомов, используемых в белке MIR:

Смотрите также

Аномальная дисперсия

Изоморфная замена

Два метода предоставления необходимой информации о фазировке путем введения тяжелых атомов в изоморфные кристаллы:

Другой

Рекомендации

  1. ^ а б Корк, Дж. М. (октябрь 1927 г.). «LX. Кристаллическая структура некоторых квасцов». Лондонский, Эдинбургский и Дублинский философский журнал и научный журнал. 4 (23): 688–698. Дои:10.1080/14786441008564371. ISSN  1941-5982.
  2. ^ Робертсон, Дж. Монтеат (1937-01-01). «Рентгеноструктурный анализ и применение методов рядов Фурье к молекулярным структурам». Отчеты о достижениях физики. 4 (1): 332–367. Дои:10.1088/0034-4885/4/1/324. ISSN  0034-4885.
  3. ^ Грин, Д. У .; Инграм, Вернон Мартин; Перуц, Макс Фердинанд; Брэгг, Уильям Лоуренс (1954-09-14). «Строение гемоглобина - IV. Определение знака методом изоморфного замещения». Труды Лондонского королевского общества. Серия А. Математические и физические науки.. 225 (1162): 287–307. Дои:10.1098 / rspa.1954.0203. S2CID  96889917.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • MAD фазировка - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.

Компьютерные программы

Учебники и примеры