Никель-зависимая гидрогеназа - Nickel-dependent hydrogenase

Никель-зависимая гидрогеназа
Идентификаторы
СимволNiFeSe_Hases
PfamPF00374
ИнтерПроIPR001501
PROSITEPDOC00400
SCOP21frv / Объем / СУПФАМ
TCDB3.D.7

Гидрогеназы ферменты, которые катализируют обратимую активацию водород и которые широко распространены в прокариоты а также в некоторых эукариоты. Существуют разные типы гидрогеназ, но все они, кажется, содержат хотя бы одну железо-серный кластер. Их можно условно разделить на две группы: гидрогеназы, содержащие никель а в некоторых случаях также селен (гидрогеназы [NiFe] и [NiFeSe]) и без никеля (гидрогеназы [Fe]).

Гидрогеназы [NiFe] и [NiFeSe] представляют собой гетеродимеры, которые состоят из небольшой субъединицы, содержащей сигнальный пептид, и большой субъединицы. Все известные крупные субъединицы, по-видимому, связаны эволюционно;[1] они содержат два мотива Cys-x-x-Cys; один на их N-конце; другой на их конце C-конца. Эти четыре цистеина участвуют в связывании никеля.[2] В гидрогеназах [NiFeSe] первый цистеин С-концевого мотива представляет собой селеноцистеин, который, как было экспериментально показано, является никелевым лигандом.[3]

использованная литература

  1. ^ Пшибила А.Е., Роббинс Дж., Менон Н.К., Шателус С.Ю., Пек HD, Чой Э.С. (1990). «Клонирование и секвенирование предполагаемого оперона гидрогеназы-1 Escherichia coli [NiFe], содержащего шесть открытых рамок считывания». J. Bacteriol. 172 (4): 1969–1977. Дои:10.1128 / jb.172.4.1969-1977.1990. ЧВК  208693. PMID  2180913.
  2. ^ Вольбеда А., Хатчикян Е.С., Пирас С., Фрей М., Фонтекилла-Кэмпс Дж. К., Харон М. Х. (1995). «Кристаллическая структура никель-железной гидрогеназы из Desulfovibrio gigas». Природа. 373 (6515): 580–587. Дои:10.1038 / 373580a0. PMID  7854413. S2CID  4335445.
  3. ^ Моура I, Eidsness MK, Скотт Р.А., Моура Дж. Дж., Легал Дж., Пек-младший HD, Прикрил BC, Дервартаниан Д.В. «Доказательства координации селеноцистеина с никелем в активном центре в гидрогеназах [NiFeSe] из Desulfovibrio baculatus». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (1): 147–151. Дои:10.1073 / пнас.86.1.147. ЧВК  286421. PMID  2521386.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001501