Семья фи11 холин - Phi11 holin family

В Семья Фи11 Холин (φ11 Холин) (TC № 1.E.11 ) составляет Холин надсемейство I.^[1]

Один охарактеризованный член этого семейства, пневмококковый фаг холин EJ-1 (EJh; ТК № 1.Е.11.1.3 ), представляет собой гидрофобный пептид длиной 85 аминоацильных остатков (aas) с двумя предполагаемыми трансмембранными сегментами (TMS), проявляющими летальную активность по разрушению внутренней мембраны.^[2] Синтетический N-концевой TMS, фланкированный его положительно заряженными N-концевыми остатками, складывается в трансмембранную α-спираль, которая увеличивает проницаемость мембраны. В зависимости от соотношения пептидов и липидов образуются олигомерные каналы различного размера. С помощью атомно-силовой микроскопии можно увидеть дыры в мембране, вызванные пептидами.^[3]

Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству холинов φ11, можно найти в База данных классификации транспортеров.

Смотрите также

дальнейшее чтение

Bon, J .; Mani, N .; Джаясвал, Р. К. (1 июля 1997 г.). «Молекулярный анализ литических генов бактериофага 80 альфа Staphylococcus aureus». Канадский журнал микробиологии 43 (7): 612–616. ISSN 0008-4166.PMID 9246739.
Cerca, N .; Oliveira, R .; Азередо, Дж. (01.09.2007). «Восприимчивость планктонных клеток и биопленок Staphylococcus epidermidis к литическому действию стафилококкового бактериофага К». Письма по прикладной микробиологии 45 (3): 313–317. Дои:10.1111 / j.1472-765X.2007.02190.x. ISSN 0266-8254. PMID 17718845.
Куртин, Джон Дж .; Донлан, Родни М. (01.04.2006). «Использование бактериофагов для уменьшения образования катетер-ассоциированных биопленок Staphylococcus epidermidis».Противомикробные препараты и химиотерапия 50 (4): 1268–1275. Дои:10.1128 / AAC.50.4.1268-1275.2006. ISSN 0066-4804. ЧВК 1426991. PMID 16569839.
Iandolo, Джон Дж .; Уоррелл, Вероника; Groicher, Kajetan H .; Цянь, Юдун; Тиан, Рунинг; Кентон, Стив; Дорман, Анджела; Цзи, Хунгуи; Линь, Шаопин (2002-05-01).«Сравнительный анализ геномов бактериофагов умеренного пояса φ11, φ12 и φ13 Staphylococcus aureus 8325». Ген 289 (1–2): 109–118.Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00481-X.
Лесснер, М. Дж .; Gaeng, S .; Wendlinger, G .; Maier, S.K .; Шерер, С. (15 мая 1998 г.). «Двухкомпонентная система лизиса бактериофага Twort Staphylococcus aureus: большой холин с началом TTG и связанный с ним эндолизин амидазы». Письма о микробиологии FEMS162 (2): 265–274. ISSN 0378-1097. PMID 9627962.
Мартинес, Вирджиния; Гарсия, Педро; Гарсия, Хосе Луис; Прието, Мария Ауксилиадора (01.07.2011). «Контролируемый автолиз способствует восстановлению полигидроксиалканоата у Pseudomonas putida KT2440». Микробная биотехнология 4(4): 533–547. Дои:10.1111 / j.1751-7915.2011.00257.x.ISSN 1751-7915. ЧВК 3815265. PMID 21418544.
Печать, Брюс С .; Fouts, Derrick E .; Симмонс, Мустафа; Гарриш, Джонна К .; Кунц, Робин Л .; Вулси, Ревекка; Schegg, Kathleen M .; Кропинский, Андрей М .; Аккерманн, Ганс-В. (01.01.2011). «Бактериофаги Clostridium perfringens ΦCP39O и ΦCP26F: геномная организация и протеомный анализ вирионов». Архив вирусологии 156 (1): 25–35.Дои:10.1007 / s00705-010-0812-z. ISSN 1432-8798.ЧВК 4127328. PMID 20963614.
Ся, Гоцин; Вольц, Кристиана (01.01.2014).«Фаги Staphylococcus aureus и их влияние на эволюцию хозяина». Инфекция, генетика и эволюция 21: 593–601. Дои:10.1016 / j.meegid.2013.04.022.

Рекомендации

^ Reddy, Bhaskara L .; Сайер, Милтон Х. (1 ноября 2013 г.). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1828 (11): 2654–2671. Дои:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. ЧВК 3788059. PMID 23856191.
^ Diaz, E .; Munthali, M .; Lunsdorf, H .; Holtje, J. V .; Тиммис, К. Н. (1996-02-01). «Двухступенчатая система лизиса пневмококкового бактериофага EJ-1 функционирует в отношении грамотрицательных бактерий: запуск основного пневмококкового автолизина в Escherichia coli». Молекулярная микробиология. 19 (4): 667–681. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.
^ Аро, Ампаро; Велес, Марисела; Гурмагтих, Эрик; Лаго, Сантьяго; Васкес, Хесус; Андреу, Дэвид; Гассет, Мария (07.02.2003). «Восстановление активности холина синтетическим пептидом, содержащим область последовательности 1-32 EJh, холин фага EJ-1». Журнал биологической химии. 278 (6): 3929–3936. Дои:10.1074 / jbc.M211334200. ISSN 0021-9258. PMID 12464609.

По состоянию на 10 марта 2016 г. эта статья полностью или частично взята из База данных классификации транспортеров (TCDB). Владелец авторских прав лицензировал контент таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с CC BY-SA 3.0 и GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены. Исходный текст был в "1.E.11 Семья φ11 Холин (φ11 Холин)"

[1] Reddy, Bhaskara L .; Сайер, Милтон Х. (1 ноября 2013 г.). «Топологический и филогенетический анализ семейств и суперсемейств бактериальных холинов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1828 (11): 2654–2671. Дои:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. ISSN 0006-3002. ЧВК 3788059. PMID 23856191.

[2] Diaz, E .; Munthali, M .; Lunsdorf, H .; Holtje, J. V .; Тиммис, К. Н. (1996-02-01). «Двухступенчатая система лизиса пневмококкового бактериофага EJ-1 функционирует в отношении грамотрицательных бактерий: запуск основного пневмококкового автолизина в Escherichia coli». Молекулярная микробиология. 19 (4): 667–681. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.399929.x. ISSN 0950-382X. PMID 8820638. S2CID 22961185.

[3] Аро, Ампаро; Велес, Марисела; Гурмагтих, Эрик; Лаго, Сантьяго; Васкес, Хесус; Андреу, Дэвид; Гассет, Мария (07.02.2003). «Восстановление активности холина синтетическим пептидом, содержащим область последовательности 1-32 EJh, холин фага EJ-1». Журнал биологической химии. 278 (6): 3929–3936. Дои:10.1074 / jbc.M211334200. ISSN 0021-9258. PMID 12464609.

[1]

[2]

[3]